
1.1 概述
K-means算法是集簡單和經典于一身的基于距離的聚類算法
采用距離作為相似性的評價指標,即認為兩個對象的距離越近,其相似度就越大。
(資料圖片僅供參考)
該算法認為類簇是由距離靠近的對象組成的,因此把得到緊湊且獨立的簇作為最終目標。
1.2 算法圖示
假設我們的n個樣本點分布在圖中所示的二維空間。
從數據點的大致形狀可以看出它們大致聚為三個cluster,其中兩個緊湊一些,剩下那個松散一些,如圖所示:
我們的目的是為這些數據分組,以便能區分出屬于不同的簇的數據,給它們標上不同的顏色,如圖:
1.3算法要點
1.3.1 核心思想
通過迭代尋找k個類簇的一種劃分方案,使得用這k個類簇的均值來代表相應各類樣本時所得的總體誤差最小。
k個聚類具有以下特點:各聚類本身盡可能的緊湊,而各聚類之間盡可能的分開。
算法的基礎是最小誤差平方和準則,
其代價函數是:
式中,μc(i)表示第i個聚類的均值。
各類簇內的樣本越相似,其與該類均值間的誤差平方越小,對所有類所得到的誤差平方求和,即可驗證分為k類時,各聚類是否是最優的。
上式的代價函數無法用解析的方法最小化,只能有迭代的方法。
1.3.2 算法步驟圖解
下圖展示了對n個樣本點進行K-means聚類的效果,這里k取2。
1.3.3 算法實現步驟
k-means算法是將樣本聚類成 k個簇(cluster),其中k是用戶給定的,其求解過程非常直觀簡單,具體算法描述如下:
1)隨機選取 k個聚類質心點
2)重復下面過程直到收斂
對于每一個樣例 i,計算其應該屬于的類:
對于每一個類 j,重新計算該類的質心:
其偽代碼如下:
********************************************************************
創建k個點作為初始的質心點(隨機選擇)
當任意一個點的簇分配結果發生改變時
對數據集中的每一個數據點
對每一個質心
計算質心與數據點的距離
將數據點分配到距離最近的簇
對每一個簇,計算簇中所有點的均值,并將均值作為質心
2. Kmeans分類算法Python實戰
2.1 需求
對給定的數據集進行聚類
本案例采用二維數據集,共80個樣本,有4個類。樣例如下:
testSet.txt
1.658985 4.285136
-3.453687 3.424321
4.838138 -1.151539
-5.379713 -3.362104
0.972564 2.924086
-3.567919 1.531611
0.450614 -3.302219
-3.487105 -1.724432
2.668759 1.594842
-3.156485 3.191137
3.165506 -3.999838
-2.786837 -3.099354
4.208187 2.984927
-2.123337 2.943366
0.704199 -0.479481
-0.392370 -3.963704
2.831667 1.574018
-0.790153 3.343144
2.943496 -3.357075
2.2 python代碼實現
2.2.1 利用numpy手動實現
from numpy import * #加載數據 def loadDataSet(fileName): dataMat = [] fr = open(fileName) for line in fr.readlines(): curLine = line.strip().split("\t") fltLine = map(float, curLine) #變成float類型 dataMat.append(fltLine) return dataMat ? # 計算歐幾里得距離 def distEclud(vecA,?vecB): return sqrt(sum(power(vecA - vecB, 2))) ? #構建聚簇中心,取k個(此例中為4)隨機質心 def randCent(dataSet, k): n = shape(dataSet)[1] centroids = mat(zeros((k,n)))#每個質心有n個坐標值,總共要k個質心 for j in range(n): minJ = min(dataSet[:,j]) maxJ = max(dataSet[:,j]) rangeJ = float(maxJ - minJ) centroids[:,j] = minJ + rangeJ * random.rand(k, 1) return centroids ? #k-means 聚類算法 def kMeans(dataSet,?k, distMeans =distEclud, createCent = randCent): m = shape(dataSet)[0] clusterAssment =?mat(zeros((m,2))) #用于存放該樣本屬于哪類及質心距離 centroids = createCent(dataSet, k) clusterChanged =?True while clusterChanged: clusterChanged = False; for i in range(m): minDist?= inf; minIndex = -1; for j in?range(k): distJI = distMeans(centroids[j,:], dataSet[i,:]) if distJI?< minDist: minDist = distJI; minIndex = j if clusterAssment[i,0] != minIndex: clusterChanged = True; clusterAssment[i,:] = minIndex,minDist**2 print centroids for cent in?range(k): ptsInClust = dataSet[nonzero(clusterAssment[:,0].A == cent)[0]] # 去第一列等于cent的所有列 centroids[cent,:] = mean(ptsInClust, axis = 0) return centroids, clusterAssment |
2.2.2 利用scikili庫實現
Scikit-Learn是基于python的機器學習模塊,基于BSD開源許可證。
scikit-learn的基本功能主要被分為六個部分,分類,回歸,聚類,數據降維,模型選擇,數據預處理。包括SVM,決策樹,GBDT,KNN,KMEANS等等
Kmeans在scikit包中即已有實現,只要將數據按照算法要求處理好,傳入相應參數,即可直接調用其kmeans函數進行聚類
################################################# # kmeans: k-means cluster ################################################# from numpy import * import time import matplotlib.pyplot as plt ## step 1:加載數據 print "step 1: load data..." dataSet = [] fileIn = open("E:/Python/ml-data/kmeans/testSet.txt") for line in fileIn.readlines(): lineArr = line.strip().split("\t") dataSet.append([float(lineArr[0]), float(lineArr[1])]) ## step 2: 聚類 print "step 2: clustering..." dataSet = mat(dataSet) k = 4 centroids, clusterAssment = kmeans(dataSet, k) ## step 3:顯示結果 print "step 3: show the result..." showCluster(dataSet, k, centroids, clusterAssment) |
2.2.3 運行結果
不同的類用不同的顏色來表示,其中的大菱形是對應類的均值質心點。
3、Kmeans算法補充
3.1 kmeans算法缺點
k-means算法比較簡單,但也有幾個比較大的缺點:
(1)k值的選擇是用戶指定的,不同的k得到的結果會有挺大的不同,如下圖所示,左邊是k=3的結果,這個就太稀疏了,藍色的那個簇其實是可以再劃分成兩個簇的。而右圖是k=5的結果,可以看到紅色菱形和藍色菱形這兩個簇應該是可以合并成一個簇的:
(2)對k個初始質心的選擇比較敏感,容易陷入局部最小值。例如,我們上面的算法運行的時候,有可能會得到不同的結果,如下面這兩種情況。K-means也是收斂了,只是收斂到了局部最小值:
(3)存在局限性,如下面這種非球狀的數據分布就搞不定了:
(4)數據集比較大的時候,收斂會比較慢。
3.2 改良思路
k-means老早就出現在江湖了。所以以上的這些不足也已有了對應方法進行了某種程度上的改良。例如:
問題(1)對k的選擇可以先用一些算法分析數據的分布,如重心和密度等,然后選擇合適的k
問題(2),有人提出了另一個成為二分k均值(bisecting k-means)算法,它對初始的k個質心的選擇就不太敏感