
Materials Studio是一個常用于材料科學領域的模擬軟件,其中腳本的作用非常關鍵。在Materials Studio中,腳本可以自動執行一系列操作來快速完成一些繁瑣、耗時的任務,如構建模型、優化結構、分析性質等,并且還提供了強大的編程接口,使用戶能夠自定義實現各種復雜的計算和分析。
(資料圖片)
如同古代兵器營一樣,Materials Studio腳本在提供了武器和裝備的同時,還需有專業的軍事工匠進行維護和修理。這就是說,想要用好腳本,就要有一定的技術實力,才能打造成出更加強大的模擬工具,取得對科學研究的更多突破。
如果Materials Studio腳本是兵器營,那么本次給大家分享的腳本就像是兵器營中的長虹劍。在古代,長虹劍是最為重要和精湛的華夏武器,其利刃可斷金剛、斬鋼如鐵。本次的腳本也同樣不可小覷,它可對多項體系內軌跡文件進行自動化高精度的相互作用能和結合能計算,以期揭示這些物質內在的物理規律。
腳本:ThreeEint
該腳本是通過實現對”set“對象之間相互作用能的準確計算,并將整個體系內的物質分批進行能量計算,以確保計算結果的準確性和效率。依據公式如下:
腳本往期回顧
東方科軟MS技術工程師專門整理并自編了一批腳本,幫助大家提升效率。
腳本中包含了Materials Studio自帶的官方腳本,也有東方科軟MS技術工程師制作的腳本,一共28個,后續將不斷添加完善,敬請關注。
Materials Studio官方腳本
23個官方腳本主要包括:
為珠子軌跡生成粗粒度交互(玻爾茲曼轉換)
使用腳本精確構建模型
對特定分子施加位移并計算能量
自動替換原子并鍵合
鍵長/鍵角列表輸出
力場格式轉換
監測體系中距離與角度的變化
演示依次處理項目中的每個結構
統計體系氫鍵鍵長與數目
演示訪問原子及其鍵合信息
移動特定分子通過沸石中的孔隙
勢能面 (PES) 掃描
晶型預測
施加應力得應變(應力應變曲線)
元素替換(枚舉合金)結構
粗?;壽E文件
指定溫度設置速度(可用于導熱率)
熔化溫度計算
東方科軟DIY腳本(持續更新ing…)
自制腳本示例1:自動計算軌跡文件相互作用能
自制腳本示例2:截斷能、K點測試腳本
在計算材料電子結構時,需要對計算所需的截斷能進行測試,以保證計算結果的準確性,但是步驟重復性太高,時間成本太高。該方法通過自動化截斷能測試,實現了計算過程的全自動化,同時保證了計算結果的準確性和可靠性。此外,該方法還具有靈活性和簡便性,可以根據不同的計算需求進行靈活的調整和修改,為材料電子結構計算提供了高效、準確的解決方案。
原理:該腳本方法通過在能量差值小于特定值時自動停止,將截斷能用于K點測試,實現了全自動化的計算過程。
Materials Studio軟件介紹
BIOVIA Materials Studio是一個多尺度、多功能的材料模擬計算平臺。在近20多年的發展歷程中,Materials Studio獲得了來自全球多個科研機構的技術支持,歷經28個版本的更新和升級,現已融合多種時間、空間尺度的模擬方法,形成了一個包含16個工具包、25個功能模塊,可實現從微觀電子結構解析到宏觀性能預測的跨尺度科學研究平臺。
目前,Materials Studio 軟件是分子模擬領域中相對精確、穩定、高效的產品,廣泛應用在化學化工、環境、制藥、能源、電子、食品、航空航天和汽車等工業領域和教育科研部門有著非常廣泛的應用。
公司介紹
東方科軟成立于2016年10月,總部設在北京,主要服務材料科學與生命科學兩大領域的用戶,為其提供模擬仿真軟件、技術咨詢、技術培訓及技術支持服務。
公司打造行業領域產品生態圈,不斷引進國內外各種先進產品與技術,為材料和藥物的設計與創新提供綜合解決方案。團隊專業背景覆蓋材料科學、物理、化學化工、石油石化、生物醫藥等重要領域,能為用戶提供專業、高效、快捷、精準的技術支持與服務。
目前,我們已服務上百家相關學術及企業用戶,為他們的產品研發和創新提供了強有力的科學信息軟件技術服務與產品支持!
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